D 293 Istanbul-Express München-Pithion
Pythio liegt an der Eisenbahnstrecke Swilengrad (Bulgarien)–Alexandroupolis–(Thessaloniki). Bedeutung hat der Ort heute vor allem durch die Tatsache, dass er der einzige bestehende Grenzbahnhof für den Eisenbahnverkehr zwischen der Türkei und Griechenland ist. Die hier abzweigende Strecke in Richtung Türkei erreicht nach Querung des Evros nach wenigen Kilometern den türkischen Grenzbahnhof Uzunköprü.
Den Grenzübergang nutzen im planmäßigen Personenverkehr derzeit täglich nur zwei Zugpaare: Der Nachtzug Thessaloniki–Istanbul–Thessaloniki, der Schlafwagen führt, und der Tagzug Istanbul–Pythion–Istanbul, der aus nur einem Wagen besteht.